Calcul de gel d’agarose

Comment calculer l’agarose pour un gel

1. Saisissez le pourcentage du gel et le volume à couler.
2. Choisissez votre tampon stock, et la concentration de votre colorant d’ADN si vous l’ajoutez au gel.
3. Les grammes d’agarose s’affichent avec le tampon et l’eau à mélanger, le volume de colorant et les tailles d’ADN que ce pourcentage sépare le mieux.

Questions fréquentes

Quelle est la formule ?

Un pourcentage de gel correspond à des grammes pour 100 mL : grammes = % × volume en mL ÷ 100. Un gel à 1 % de 50 mL demande 0,5 g d’agarose.

Quel pourcentage choisir ?

Les faibles pourcentages séparent l’ADN de grande taille, les forts les petits fragments. En gros : 0,7 % pour 0,8 à 12 kb, 1 % pour 0,5 à 10 kb, 1,5 % pour 0,2 à 3 kb et 2 % pour 50 pb à 2 kb.

TAE ou TBE ?

Le TAE convient mieux aux grands fragments et à l’extraction de bandes ; le TBE donne des bandes plus nettes pour les petits fragments et tient mieux les migrations longues.