Double hélice d'ADN en 3D

Comment utiliser le visualiseur d'ADN 3D

1. Tapez ou collez une séquence d'ADN (A, C, G et T ; jusqu'à 80 bases sont dessinées). Chaque paire de bases devient un barreau : A vert s'apparie avec T rouge, G bleu avec C jaune.
2. Activez Afficher les bases pour étiqueter chaque moitié de chaque barreau, et désactivez Rotation pour tourner l'hélice vous-même.
3. La longueur, le nombre de tours, le taux de GC et le complément inverse sont calculés d'après la séquence ; les outils Complément inverse et Statistiques d'ADN font de même pour des séquences de n'importe quelle longueur.

Questions fréquentes

Quelles sont les dimensions de l'ADN ?

L'ADN-B, la forme habituelle, mesure 2 nm de diamètre, s'élève de 0,34 nm par paire de bases et fait un tour complet toutes les 10,5 paires de bases, soit 3,4 nm. Les 3 milliards de paires de bases d'une cellule humaine mesureraient environ 1 mètre une fois déroulées.

Pourquoi y a-t-il deux sillons de tailles différentes ?

Les deux squelettes ne sont pas diamétralement opposés mais à environ 150° l'un de l'autre, donc l'espace entre eux est large d'un côté (grand sillon, 2,2 nm) et étroit de l'autre (petit sillon, 1,2 nm). Les protéines qui lisent l'ADN se fixent surtout dans le grand sillon, où les bords des paires de bases sont exposés.

Pourquoi le taux de GC compte-t-il ?

Les paires G–C sont maintenues par trois liaisons hydrogène et les paires A–T par deux, donc l'ADN riche en GC est plus stable et fond à plus haute température. Le guide sur le taux de GC explique ce qu'il influence.

Il est indiqué que WebGL est désactivé.

La vue 3D a besoin de WebGL, présent dans tous les navigateurs actuels. Il peut être désactivé si l'accélération matérielle est coupée dans les réglages du navigateur, ou à cause d'un pilote graphique très ancien. Activez l'accélération matérielle ou essayez un autre navigateur.

Quelque chose est-il envoyé ?

Non. La simulation est dessinée par votre propre navigateur avec WebGL ; rien n'est envoyé nulle part, et elle continue de fonctionner hors ligne une fois la page chargée.