3D DNA 二重らせん

3D DNA ビューアの使い方

1. DNA 配列（A、C、G、T。最大 80 塩基まで描画）を入力または貼り付けます。各塩基対が横木になり、緑の A は赤の T と、青の G は黄の C と対になります。
2. 「塩基を表示」をオンにすると各横木の両半分にラベルがつき、「回転」をオフにすると自分で回せます。
3. 長さ、回転数、GC 含量、逆相補鎖は配列から計算されます。逆相補鎖と DNA 統計のツールは、どんな長さの配列でも同じことをします。

よくある質問

DNA の寸法は？

通常の形である B 型 DNA は直径 2 nm、塩基対 1 つあたり 0.34 nm 上昇し、10.5 塩基対（3.4 nm）で 1 回転します。ヒトの細胞 1 個の 30 億塩基対を伸ばすと約 1 メートルになります。

大きさの違う 2 つの溝があるのはなぜ？

2 本の骨格はらせんの反対側にあるのではなく約 150° 離れているため、その間の隙間が片側では広く（主溝、2.2 nm）、反対側では狭く（副溝、1.2 nm）なります。DNA を読むタンパク質の多くは、塩基対の縁が露出している主溝に結合します。

GC 含量はなぜ重要ですか？

G–C 対は水素結合 3 本、A–T 対は 2 本で保たれているため、GC に富む DNA は安定で融解温度が高くなります。GC 含量のガイドに影響の解説があります。

WebGL が無効と表示されます。

3D 表示には WebGL が必要で、現行のブラウザはすべて対応しています。ブラウザ設定でハードウェアアクセラレーションが無効になっているか、グラフィックドライバーが非常に古いと無効になることがあります。ハードウェアアクセラレーションを有効にするか、別のブラウザをお試しください。

何かアップロードされますか？

いいえ。シミュレーションはお使いのブラウザが WebGL で描画しています。どこにも送信されず、ページを一度読み込めばオフラインでも動きます。