3D 分子ビューア

3D 分子ビューアの使い方

1. 分子を選びます。原子は元素ごとに色分けされ（水素は白、炭素は黒、酸素は赤、窒素は青、塩素は緑、ナトリウムは紫）、棒が結合を表します。
2. 空間充填に切り替えると各原子が実際に占める大きさがわかり、「回転」をオフにすると手で回せます。
3. 分子量は原子から足し合わせています。モル質量の計算はどんな化学式でも同じ計算をします。

よくある質問

水は折れ曲がり、二酸化炭素はまっすぐなのはなぜ？

水の酸素には結合電子対が 2 つと非共有電子対が 2 つあり、互いに反発して四面体型に配置するため、H–O–H の角度は 104.5° になります。CO₂ の炭素は二重結合が 2 つで非共有電子対がないので、できるだけ離れた 180° に並びます。

位置は正確ですか？

結合の長さと角度は各分子の実験値です（O–H 0.96 Å、C–H 1.09 Å、C=O 1.16 Å など）。空間充填の半径はファンデルワールス半径です。模型は静止していますが、実際の分子は振動し、エタノールや酢酸は単結合の周りで回転します。

塩化ナトリウムが格子で表示されるのはなぜ？

NaCl には分子がありません。ナトリウムイオンと塩化物イオンが繰り返しの立方格子に詰まり、各イオンは反対種のイオン 6 個と接しています。NaCl という式は比を表すだけです。ビューアはその 3 × 3 × 3 の一部を示しており、塩の粒一つでは 10¹⁸ 個のイオンにわたって同じ模様が続きます。

WebGL が無効と表示されます。

3D 表示には WebGL が必要で、現行のブラウザはすべて対応しています。ブラウザ設定でハードウェアアクセラレーションが無効になっているか、グラフィックドライバーが非常に古いと無効になることがあります。ハードウェアアクセラレーションを有効にするか、別のブラウザをお試しください。

何かアップロードされますか？

いいえ。シミュレーションはお使いのブラウザが WebGL で描画しています。どこにも送信されず、ページを一度読み込めばオフラインでも動きます。