AvrII-র চেনার জায়গা

সংক্ষেপে AvrII

5' C|CTAGG 3'
3' GGATC|C 5'

একটি সিকোয়েন্সে AvrII-র জায়গা কীভাবে খুঁজবেন

1. আপনার DNA সিকোয়েন্স বা FASTA নথিটি ওপরের বাক্সে সেঁটে দিন। AvrII আগেই “শুধু এই এনজাইমগুলো” ঘরে লেখা আছে।
2. এটি একটি প্লাজমিড হলে শেষ থেকে শুরু পর্যন্ত ছড়ানো একটি জায়গাও খুঁজে পেতে “বৃত্তাকার DNA” ঘরটিতে টিক দিন।
3. ম্যাপটি AvrII-র প্রতিটি কাটা তার অবস্থানসহ চিহ্নিত করে। ফলটি নিচ থেকে নকল করে নিন বা নামিয়ে নিন।

সাধারণ প্রশ্ন

AvrII কোন সিকোয়েন্স কাটে?

AvrII CCTAGG সিকোয়েন্সটি চেনে (5′→3′ দিকে) আর ওপরের সূত্রকটি C^CTAGG বিন্দুতে কাটে।

AvrII আঠালো না ভোঁতা প্রান্ত রেখে যায়?

আঠালো প্রান্ত: ৪ বেসের 5′ ঝুলন্ত প্রান্ত (CTAG)।

কোন এনজাইমগুলো AvrII-র সঙ্গে মানানসই প্রান্ত রেখে যায়?

NheI, SpeI আর XbaI। তাদের ঝুল একই, তাই প্রান্তগুলো লাইগেশনে একে অন্যের সঙ্গে জুড়ে যেতে পারে।

AvrII কত ঘন ঘন কাটে?

CCTAGG-র মতো একটি জায়গা দেখা যায় এলোমেলো DNA-তে প্রায় প্রতি ৪,০৯৬ bp-তে একবার। আসল সিকোয়েন্সে ফের হয়, তাই নিজেরটি ওপরে দেখে নিন।