Toolyard

Как ссылаться на онлайн-инструменты и программы в статье

Зачем вообще ссылаться на инструменты

Результаты зависят от программ, которые их получили. Название инструмента, его версия и настройки позволяют другим повторить работу, и многие журналы теперь этого требуют.

Что указать

  • Название инструмента и, для устанавливаемых программ, версию.
  • Где его найти: URL или статью, где он описан.
  • Настройки, которые вы изменили относительно стандартных, например генетический код, PAM или параметры выравнивания.
  • Дату использования — для веб-инструментов, которые могут меняться.
  • RRID, если он есть.

Что такое RRID

Research Resource Identifier — постоянный идентификатор антитела, клеточной линии, организма или программы, например RRID:SCR_029096. У программ и онлайн-инструментов идентификаторы начинаются с SCR_. Многие журналы требуют RRID, потому что по ним можно искать в разных статьях и они не ломаются при переезде сайта. Найти их можно в реестре ресурсов SciCrunch.

Примеры

Температуры плавления праймеров рассчитаны в Toolyard Primer Tm Calculator (https://webtoolyard.com/primer-tm-calculator/, RRID:SCR_029096), дата обращения 5 октября 2026 г., с концентрациями соли и праймеров, использованными в ПЦР.

Направляющие РНК выбраны с помощью Toolyard CRISPR Guide Finder (RRID:SCR_029096) с PAM NGG и проверены на нецелевые сайты по геному GRCh38.

На любой инструмент Toolyard, например Обратный комплемент, Поиск гидов CRISPR и Калькулятор молярности, можно сослаться с тем же RRID.

В списке литературы

Большинство стилей рассматривают веб-инструмент как программное обеспечение. В стиле APA — с датой обращения, потому что страница может меняться:

Toolyard. (n.d.). Primer Tm calculator [Web application]. Retrieved October 5, 2026, from https://webtoolyard.com/primer-tm-calculator/

Журналы с нумерованными ссылками обычно хотят те же части: название инструмента, сайт, URL и дату обращения. Российские журналы часто оформляют ссылки по ГОСТ Р 7.0.100–2018, где для электронного ресурса тоже указывают URL и дату обращения. Если требования журнала отличаются, следуйте им.

Где это в статье

Назовите инструмент в разделе методов рядом с этапом, для которого он использовался, с настройками. Полную ссылку поместите в список литературы, а RRID — в методы или таблицу ключевых ресурсов, если она есть в журнале.

Частые ошибки

  • Ссылка только на главную страницу. Указывайте адрес инструмента, которым вы действительно пользовались, чтобы читатель попал на нужную страницу.
  • Пропущенные настройки. «Праймеры были подобраны онлайн» повторить нельзя. Укажите концентрацию солей, PAM, генетический код или что ещё вы меняли.
  • Правка результата без упоминания. Если вы поправили результат вручную, например укоротили праймер, напишите, что изменили.

Инструменты из этого руководства

Другие руководства