Pourquoi citer ses outils
Les résultats dépendent du logiciel qui les a produits. Indiquer l'outil, sa version et ses réglages permet aux autres de refaire le travail, et beaucoup de revues l'exigent désormais.
Ce qu'il faut indiquer
- Le nom de l'outil et, pour un logiciel installé, sa version.
- Où le trouver : une URL ou l'article qui le décrit.
- Les réglages modifiés par rapport aux valeurs par défaut, comme le code génétique, le PAM ou le score d'alignement.
- La date d'utilisation, pour les outils web susceptibles de changer.
- Un RRID, s'il en a un.
Ce qu'est un RRID
Un Research Resource Identifier est un identifiant permanent pour un anticorps, une lignée cellulaire, un organisme ou un logiciel, comme RRID:SCR_029096. Les logiciels et outils en ligne ont des identifiants commençant par SCR_. Beaucoup de revues demandent des RRID parce qu'on peut les rechercher dans tous les articles et qu'ils ne cassent pas quand un site change d'adresse. On les trouve dans le registre de ressources SciCrunch.
Exemples
Les températures de fusion des amorces ont été calculées avec le calculateur de Tm de Toolyard (https://webtoolyard.com/fr/primer-tm-calculator/, RRID:SCR_029096), consulté le 5 octobre 2026, avec les concentrations de sel et d'amorces utilisées dans la PCR.
Les ARN guides ont été choisis avec le Chercheur de guides CRISPR de Toolyard (RRID:SCR_029096) avec le PAM NGG, puis vérifiés pour les sites hors cible sur le génome GRCh38.
Tous les outils Toolyard, comme le Complément inverse, le Chercheur de guides CRISPR ou le Calculateur de molarité, peuvent être cités avec le même RRID.