なぜツールを引用するのか
結果は、それを出したソフトウェアに左右されます。ツール名、バージョン、設定を書けば他の人が再現でき、今では多くの学術誌がそれを求めています。
書くべきこと
- ツール名と、インストール型のソフトウェアならバージョン。
- 入手先：URLまたはツールを報告した論文。
- 遺伝暗号、PAM、アラインメントのスコアなど、初期値から変えた設定。
- 内容が変わる可能性のあるWebツールなら、使った日付。
- RRIDがあればRRID。
RRIDとは
Research Resource Identifier（RRID）は、抗体、細胞株、生物、ソフトウェアなどに付く恒久的なIDで、RRID:SCR_029096のような形です。ソフトウェアやオンラインツールのIDはSCR_で始まります。論文をまたいで検索でき、Webサイトの移転でリンク切れにならないため、多くの学術誌がRRIDを求めています。RRIDはSciCrunchのリソース登録簿で調べられます。
引用例
Primer melting temperatures were calculated with the Toolyard Primer Tm Calculator (https://webtoolyard.com/ja/primer-tm-calculator/, RRID:SCR_029096), accessed 5 October 2026, with the salt and primer concentrations used in the PCR.
ガイドRNAはToolyard CRISPRガイド検索（RRID:SCR_029096）でNGG PAMを用いて選び、GRCh38ゲノムに対してオフターゲット部位を確認した。
逆相補鎖、CRISPRガイド検索、モル濃度の計算など、Toolyardのツールはすべて同じRRIDで引用できます。