ΔΔCt 計算

ΔΔCt 法で発現変動を計算する方法

1. 処理群と対照群について、標的遺伝子と参照遺伝子の Ct 値を入力します。スペースで区切った複数の反復は平均されます。
2. 2^-ΔΔCt 法なら両方の効率を 100% のままにし、Pfaffl 法なら測定した効率を入力します。
3. 対照群に対する処理群の発現変動が、ΔCt、ΔΔCt、log2 発現変動とともに表示されます。

よくある質問

式は？

各サンプルで ΔCt = 標的の Ct − 参照の Ct、ΔΔCt = 処理群の ΔCt − 対照群の ΔCt、発現変動 = 2^-ΔΔCt です。

プライマー効率はいつ使いますか？

効率が 100% から、または互いに離れているときです。Pfaffl 比は E 標的^(標的 Ct 対照 − 標的 Ct 処理) ÷ E 参照^(参照 Ct 対照 − 参照 Ct 処理) で、E = 1 + 効率です。両方 100% なら 2^-ΔΔCt と同じ結果になります。

発現変動が 1 未満とは？

処理群での標的の発現が対照群より少ないという意味です。発現変動 0.5 は log2 発現変動 −1、つまり発現が半分です。