Kalkulator ΔΔCt

Cara menghitung perubahan lipat dengan ΔΔCt

1. Ketik nilai Ct gen target dan gen referensi untuk sampel perlakuan dan kontrol. Beberapa ulangan yang dipisah spasi akan dirata-rata.
2. Biarkan kedua efisiensi pada 100% untuk metode 2^-ΔΔCt, atau ketik efisiensi terukur untuk memakai metode Pfaffl.
3. Perubahan lipat sampel perlakuan terhadap kontrol muncul, beserta ΔCt, ΔΔCt, dan log2 perubahan lipat.

Pertanyaan umum

Apa rumusnya?

ΔCt = Ct target − Ct referensi untuk setiap sampel, ΔΔCt = ΔCt perlakuan − ΔCt kontrol, dan perubahan lipat = 2^-ΔΔCt.

Kapan memakai efisiensi primer?

Jika efisiensinya jauh dari 100% atau berbeda satu sama lain. Rasio Pfaffl adalah E target^(Ct target kontrol − Ct target perlakuan) ÷ E referensi^(Ct referensi kontrol − Ct referensi perlakuan), dengan E = 1 + efisiensi. Jika keduanya 100%, hasilnya sama dengan 2^-ΔΔCt.

Apa arti perubahan lipat di bawah 1?

Gen target lebih sedikit diekspresikan pada sampel perlakuan daripada kontrol. Perubahan lipat 0,5 sama dengan log2 −1, yaitu setengah ekspresi.