ΔΔCt-Rechner

So berechnest du den Fold-Change mit ΔΔCt

1. Gib die Ct-Werte von Zielgen und Referenzgen für die behandelte Probe und die Kontrolle ein. Mehrere durch Leerzeichen getrennte Replikate werden gemittelt.
2. Lass beide Effizienzen für die 2^-ΔΔCt-Methode auf 100 %, oder gib die gemessenen Effizienzen für die Pfaffl-Methode ein.
3. Der Fold-Change der behandelten Probe gegenüber der Kontrolle erscheint mit ΔCt, ΔΔCt und dem log2-Fold-Change.

Häufige Fragen

Wie lautet die Formel?

ΔCt = Ct Ziel − Ct Referenz für jede Probe, ΔΔCt = ΔCt behandelt − ΔCt Kontrolle und Fold-Change = 2^-ΔΔCt.

Wann nutze ich die Primereffizienzen?

Wenn sie von 100 % oder voneinander abweichen. Das Pfaffl-Verhältnis ist E Ziel^(Ct Ziel Kontrolle − Ct Ziel behandelt) ÷ E Referenz^(Ct Referenz Kontrolle − Ct Referenz behandelt), mit E = 1 + Effizienz. Bei 100 % für beide ergibt es dasselbe wie 2^-ΔΔCt.

Was bedeutet ein Fold-Change unter 1?

Das Zielgen wird in der behandelten Probe schwächer exprimiert als in der Kontrolle. Ein Fold-Change von 0,5 ist ein log2-Fold-Change von −1, also halbe Expression.