Pourquoi cela arrive
Un PDF enregistre chaque ligne de la page séparément : en copiant un paragraphe, on obtient un saut de ligne partout où la page revenait à la ligne. Les e-mails en texte brut font de même vers 70 caractères.
Joindre toutes les lignes
Collez le texte dans Rechercher et remplacer et cochez Expression régulière. Cherchez \s*\n\s* et remplacez par une seule espace. Chaque saut de ligne, avec les espaces autour, devient une espace.
Garder les paragraphes
En général, les paragraphes sont séparés par une ligne vide et on veut seulement joindre les lignes à l'intérieur. Avec Expression régulière cochée, cherchez (?<!\n)\n(?!\n) et remplacez par une espace. Cela ne trouve un saut de ligne que s'il n'y en a pas un autre juste avant ou après, donc les lignes vides entre paragraphes restent.
Réparer les césures
Si des mots ont été coupés entre deux lignes, comme exem- et ple, cherchez d'abord -\n et remplacez par rien. Vérifiez ensuite les vrais mots à trait d'union tombés en fin de ligne.
Autres nettoyages
Cherchez {2,} (une espace suivie de {2,}) et remplacez par une espace pour supprimer les doubles espaces. Pour enlever les lignes répétées, utilisez Supprimer les lignes en double, puis vérifiez la longueur avec le Compteur de mots.