Toolyard

Rastgele dizi

Rastgele DNA ya da protein dizisi nasıl üretilir

  1. DNA ya da protein seç; sonra uzunluğu, dizi sayısını ve DNA için GC oranını ayarla.
  2. «Oluştur»a tıkla.
  3. Her dizi bir FASTA kaydıdır. «Çıktıyı kopyala» ya da «İndir» sonucu kaydeder.

Sık sorulan sorular

Ne kadar rastgele?

Tarayıcının kriptografik rastgele sayı üretecini kullanır. Her baz tek başına çekilir; bu yüzden GC içeriği belirlediğine yakındır ama diziler arasında biraz değişir.

GC içeriği nedir?

G ya da C olan bazların payı. Genomlar arasında büyük farklar vardır: insan genomu yaklaşık %41 GC’dir, bazı bakteriler %30’un altında ya da %70’in üstündedir.

Metiyoninle başlıyor mu?

Hayır. Her konum rastgele çekilir. Bir başlangıç kodonu istiyorsan Rastgele kodlayan DNA aracını kullan.

Rastgele proteinler ne için kullanılır?

Hizalamalar, motif aramaları ve tahmin araçları için kontrol olarak: gerçek bir eşleşme aynı uzunluktaki rastgele dizilerden daha iyi puan almalıdır.

Diziler bir yerde saklanıyor mu?

Hayır. Tarayıcında üretilirler ve kopyalamaz ya da indirmezsen sayfayı kapattığında kaybolurlar.

Bu aracı kendi sitene ekle

Diğer DNA ve protein dizisi araçları